Τα ερευνητικά αντικείμενα του ΕΒΙΜΗΤΕΠ είναι:
- Αξιοποίηση υπολειμμάτων τροφίμων για παραγωγή βιοαιθανόλης.
- Αξιοποίηση ειδών προσωπικής υγιεινής (βρεφικές πάνες, πάνες ακράτειας) για παραγωγή βιοαερίου.
- Αξιοποίηση αγροτοκτηνοτροφικών αποβλήτων μέσω ανάπτυξης μικροφυκών.
- Μείωση φαινολικών ουσιών σε απόβλητα ελαιοτριβείου.
- Ποιοτικός και ποσοτικός προσδιορισμός φαρμακευτικών ουσιών σε περιβαλλοντικά δείγματα.
- Παραγωγή υδρογόνου από μικροφύκη.
- Παραγωγή υδρογόνου από απορρίμματα χαρτιού.
- Παραγωγή βιο-επιφανειοδραστικών ουσιών από ρεύματα αγροτοκτηνοτροφικών αποβλήτων.
- Βιολογική αφαίρεση αζώτου από ρεύματα υγρών αποβλήτων (μέσω παράκαμψης της παραγωγής νιτρικών).
- Έλεγχος της αντιμικροβιακής δράσης νέων υλικών-φωτοκαταλυτών.